More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4112 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 
279 aa  296  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
279 aa  295  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  49.1 
 
 
278 aa  290  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  42.08 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  42.02 
 
 
284 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  41.42 
 
 
273 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 
310 aa  188  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
405 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.76 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.86 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.14 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.47 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.9 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  24.26 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  23.75 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  24.22 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  32.03 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
387 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.3 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.2 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  22.98 
 
 
562 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.45 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.25 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.41 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.94 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.94 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.94 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.62 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  24.24 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.46 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.74 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.47 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  21.86 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.51 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  22.05 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.47 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30.47 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  21.95 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  21.56 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.89 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.81 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.47 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.51 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.89 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  23.68 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  22.27 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  22.27 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  21.86 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  22.27 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  24.44 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.4 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  20.72 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  21.54 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  20.28 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.11 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  21.46 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
404 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  21.34 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  25.67 
 
 
462 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>