More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1463 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 
293 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  54.17 
 
 
278 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  50.39 
 
 
285 aa  275  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  50.39 
 
 
271 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  46.42 
 
 
276 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 
277 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 
288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  37.69 
 
 
286 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
289 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
277 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.23 
 
 
288 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
289 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
287 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  34.91 
 
 
291 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
298 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
279 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.33 
 
 
293 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
288 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.33 
 
 
288 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  32.33 
 
 
293 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
283 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.33 
 
 
288 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.33 
 
 
293 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.33 
 
 
293 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
288 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
294 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
289 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
298 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  34.7 
 
 
289 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
302 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
295 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
284 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
288 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
287 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
288 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
273 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
281 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  32.35 
 
 
275 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
276 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
288 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.89 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
285 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
291 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
290 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
278 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
304 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.29 
 
 
271 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
278 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.35 
 
 
291 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
277 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
273 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
297 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
281 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
279 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
297 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
297 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
299 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
312 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
283 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
254 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
283 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.66 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
286 aa  99  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  25.86 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.46 
 
 
369 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
311 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.7 
 
 
374 aa  92.4  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
253 aa  92  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
293 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
284 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
290 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
279 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>