More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4414 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
277 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  50.53 
 
 
287 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 
289 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
289 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  40.21 
 
 
289 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  41.55 
 
 
286 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 
286 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
298 aa  202  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  39.3 
 
 
288 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
288 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 
288 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  38.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.3 
 
 
288 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
288 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.3 
 
 
288 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 
289 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 
284 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 
273 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
276 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 
279 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  39.33 
 
 
278 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 
304 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  37.77 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  40.82 
 
 
275 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
295 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
298 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 
286 aa  168  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 
282 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  36.93 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  36.01 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
283 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
291 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
273 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
293 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
278 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  36.53 
 
 
271 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 
283 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 
283 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
302 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  34.05 
 
 
279 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 
276 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
290 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  36.64 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
285 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 
293 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
283 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
288 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
283 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
289 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
291 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
285 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
286 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
290 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
316 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
299 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
302 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
282 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  28.47 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  31.39 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.71 
 
 
369 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
293 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>