More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0208 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  47.29 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  39.11 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  36.92 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.87 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  37.11 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  38.06 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  33.33 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.45 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  30.94 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  30.71 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.89 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.89 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  29.89 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.89 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.89 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.89 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  31.02 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.07 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 361 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.36 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>