More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4895 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  48.55 
 
 		 279 aa  258  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 		 277 aa  211  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 283 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  34.69 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  33.96 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.69 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.63 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3771  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3844  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.14 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.14 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.14 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.14 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  29.14 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 315 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.14 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 		 284 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.83 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  27.74 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 285 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.97 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.98 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  29.18 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.65 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>