More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0911 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
289 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  93.99 
 
 
298 aa  557  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  82.35 
 
 
289 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  81.88 
 
 
288 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  77 
 
 
289 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  77.27 
 
 
287 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  73.68 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  72.38 
 
 
288 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  67.96 
 
 
293 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  67.61 
 
 
288 aa  424  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  67.96 
 
 
288 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  67.96 
 
 
293 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  67.96 
 
 
293 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  67.96 
 
 
288 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  67.96 
 
 
293 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  67.96 
 
 
288 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  56.34 
 
 
286 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  56.34 
 
 
286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 
295 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
277 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  39.25 
 
 
291 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  39.79 
 
 
289 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 
279 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
287 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
277 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
285 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
285 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
285 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.01 
 
 
284 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
298 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  36.53 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  35.47 
 
 
289 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
288 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 
293 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  35.51 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
276 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
293 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 
278 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
285 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  33.22 
 
 
279 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 
273 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  34.81 
 
 
271 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.46 
 
 
288 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 
285 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
279 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 
276 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  34.64 
 
 
291 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
304 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
283 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
278 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
282 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.96 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
271 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
278 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
283 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
291 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
276 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
286 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
283 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
279 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
277 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
286 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
285 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
284 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
309 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.92 
 
 
370 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
299 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
275 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 
368 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>