More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0210 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  47.29 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  38.25 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  34.53 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  36.46 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  35.74 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.51 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  36.63 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  37.05 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  34.08 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  35.79 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  34.1 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  32.75 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  32.12 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  27.8 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.89 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.63 
 
 		 371 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.63 
 
 		 371 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.35 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.35 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.68 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.26 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>