More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2147 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  54.74 
 
 
293 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  54.17 
 
 
278 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 
285 aa  251  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 
271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  43.03 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
279 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.36 
 
 
288 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
298 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  33.91 
 
 
286 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
287 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  33.45 
 
 
289 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
294 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.16 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.58 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.21 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.58 
 
 
293 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.58 
 
 
293 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.58 
 
 
293 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  32.58 
 
 
293 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
284 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
288 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
283 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
302 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
298 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
279 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
277 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
304 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.51 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.06 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
288 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
286 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
283 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
283 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
283 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
290 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
289 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
276 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
291 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
285 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.41 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.18 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
282 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
279 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
314 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 
287 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  25.46 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
284 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  27.52 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
253 aa  85.9  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
284 aa  85.5  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>