More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06565 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  73.81 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  66.8 
 
 
253 aa  363  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  53.54 
 
 
255 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  53.01 
 
 
254 aa  284  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  48.4 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  49.4 
 
 
258 aa  265  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  50.2 
 
 
257 aa  265  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  49.21 
 
 
252 aa  261  8e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  43.62 
 
 
285 aa  234  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  42.52 
 
 
263 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  43.35 
 
 
234 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
296 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.86 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
289 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
277 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
287 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  25.86 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
287 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
288 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26 
 
 
369 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.62 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.84 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.25 
 
 
291 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0446  triacylglycerol lipase, putative  26.91 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00963592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.5 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.77 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  26.15 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  24.32 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.92 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  20.88 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  25.78 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.42 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.97 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.22 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  21.35 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
289 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  21.83 
 
 
368 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.05 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  29.83 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.71 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>