More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2894 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
287 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  50.53 
 
 
277 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  38.83 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
289 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.79 
 
 
288 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  37.46 
 
 
288 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  40.67 
 
 
288 aa  188  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  40.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  40.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  40.3 
 
 
288 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  40.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 
288 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  40.3 
 
 
293 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  40.3 
 
 
288 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
288 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  38.98 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
286 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
295 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 
294 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  40.89 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
299 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
299 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
299 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
289 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 
282 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
277 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
291 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  37.28 
 
 
275 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
298 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
279 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.27 
 
 
278 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  36.4 
 
 
271 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
286 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 
284 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  36.07 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
276 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 
304 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.71 
 
 
291 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
288 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
289 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
293 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
283 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
282 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
286 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
285 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
277 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
309 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
254 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  28.83 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.21 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.54 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.54 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  26.04 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  32.14 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  25.44 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>