More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4600 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  42.29 
 
 
268 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 
257 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 
275 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
404 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 
290 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 
265 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 
298 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
257 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
323 aa  92  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  31.1 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.45 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.45 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
397 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
309 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.52 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.15 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  28.02 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  28.02 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  28.02 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  28.02 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2263  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3221  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000558124  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  30.47 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  21.35 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.85 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  38 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
333 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.34 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0016  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  38.04 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  26.96 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  26.32 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>