More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1698 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
397 aa  819    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0016  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2263  alpha/beta hydrolase fold protein  34.3 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
264 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
425 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
285 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
295 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
273 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
263 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
299 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
286 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
287 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
262 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 
299 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  27.94 
 
 
269 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
256 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
308 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
226 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  28.68 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.78 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  28.68 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
271 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
271 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  28.29 
 
 
296 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
323 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  28.68 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 
253 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
279 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  22.52 
 
 
571 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
272 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.05 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  25.86 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 
258 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1572  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
281 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
270 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
254 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.07 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
302 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
321 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  22.47 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  24.54 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.63 
 
 
270 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.78 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.93 
 
 
270 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
275 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
265 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.3 
 
 
270 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
276 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.64 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.28 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
266 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
252 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.93 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>