More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1210 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  98.24 
 
 
284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  77.45 
 
 
285 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  60.9 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13370  hypothetical protein  60.38 
 
 
248 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
273 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.98 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.45 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.26 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.2 
 
 
369 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
381 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  27.24 
 
 
288 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
361 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.81 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  25.45 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.74 
 
 
370 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  24.65 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.4 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  38.46 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  25.45 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.01 
 
 
367 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
333 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  26.04 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.93 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  37.5 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
350 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
350 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  22.02 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.73 
 
 
371 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
352 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
266 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.91 
 
 
371 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.91 
 
 
371 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
340 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
340 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  30.56 
 
 
320 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
340 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  25 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
301 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  22.69 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
307 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
266 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>