More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0862 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 298 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  35.41 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.61 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.49 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.46 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  42.86 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  29.48 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  25.4 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  31.03 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  36.21 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.68 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  33.61 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  32.77 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  33.61 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  33.61 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  22.51 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  35.71 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  33.61 
 
 		 618 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  32.77 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  32.77 
 
 		 617 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  32.77 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  29.85 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  29.55 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  43.82 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>