More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0109 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
296 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
311 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
309 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.41 
 
 
315 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.41 
 
 
315 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
292 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
311 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
315 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
312 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
333 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.18 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.87 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.15 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.71 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.69 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.57 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.29 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.93 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.93 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  21.31 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  25.57 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
363 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.07 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.23 
 
 
371 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.56 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.43 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.28 
 
 
370 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.42 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  24.23 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.27 
 
 
371 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.68 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.06 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  19.93 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
236 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
404 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  22.13 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10991  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.312189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>