More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3216 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
302 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
302 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  35.14 
 
 
302 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.7 
 
 
281 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
291 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
314 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
280 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  35.22 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
266 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.08 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.97 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  27.73 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.65 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  26.98 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
322 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  26.33 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
272 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.38 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.15 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  29.47 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  29.02 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.44 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  25.54 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  25.52 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  25 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.91 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
397 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
338 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  27.47 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>