More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6102 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  97.41 
 
 		 270 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  87.36 
 
 		 270 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  92.94 
 
 		 270 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  91.45 
 
 		 270 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  91.45 
 
 		 270 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  70.08 
 
 		 272 aa  390  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  68.32 
 
 		 281 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  68.3 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  65.66 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  68.22 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  68.94 
 
 		 271 aa  361  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  70.66 
 
 		 269 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  70.66 
 
 		 269 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  45.08 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  51.91 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  53.2 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 425 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  34.43 
 
 		 233 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  33.76 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  33.96 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  33.76 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  31.46 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  31.46 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  31.84 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  31.46 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  34.5 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.6 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  30.7 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.82 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  32.47 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.15 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 326 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  29.6 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 323 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.37 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.02 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 327 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.87 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  30.53 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  28.1 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.84 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.46 
 
 		 374 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31.1 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 239 aa  85.5  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.22 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.88 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.44 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>