More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0351 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  80.99 
 
 		 285 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  32.62 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.96 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.03 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  46.22 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.94 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.99 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  27.44 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  29.51 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 276 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  28.96 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 226 aa  89.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 250 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  39.25 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  39.25 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  25 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  23.75 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  23.62 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25.32 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  21.85 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.92 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.98 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  24.81 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  30.4 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  26.12 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  25.77 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.06 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  34.55 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  26.24 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>