More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4123 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  89.9 
 
 		 298 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  64.16 
 
 		 277 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  61.23 
 
 		 278 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  55.96 
 
 		 284 aa  326  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 		 285 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  47 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  43.55 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  48.07 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  40.36 
 
 		 280 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  39.22 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  39.78 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  41.11 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.93 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  42.29 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  34.04 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.4 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  32.38 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.35 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.31 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  32.39 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.45 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  25.74 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  26.03 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.79 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.2 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  27.86 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.09 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  25.52 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  30.07 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  30.25 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.81 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.57 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.05 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.22 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.12 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>