More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0267 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 
277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  88.77 
 
 
278 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  64.16 
 
 
298 aa  347  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  63.54 
 
 
298 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  50.36 
 
 
284 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  44.8 
 
 
285 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  44.28 
 
 
285 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  42.05 
 
 
281 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 
286 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  45.32 
 
 
279 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  43.43 
 
 
280 aa  221  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 
284 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 
314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  39.22 
 
 
286 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 
278 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  41.22 
 
 
322 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
287 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  38.73 
 
 
282 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
289 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
287 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.96 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  33.94 
 
 
286 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.82 
 
 
295 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
331 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.59 
 
 
277 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
284 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.9 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.64 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  27.07 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  26.47 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  24.33 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  25.48 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.67 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.94 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  22.96 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  24.33 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.85 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  23.17 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.27 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  24.52 
 
 
425 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  25.18 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  21.98 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.27 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  23.94 
 
 
287 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  22.34 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.88 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  24.2 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  23.04 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  20.16 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  22.66 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>