More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3061 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  55.68 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  51.09 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  47.33 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  43.98 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.6 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.21 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.03 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  32.1 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.72 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.99 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.52 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.26 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.05 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.97 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.94 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.88 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  29.29 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.26 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.71 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  29.92 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  26.57 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  28.93 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.46 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  28.14 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  28.14 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.92 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  28.14 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2086  twin-arginine translocation pathway signal  25.64 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  28.14 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>