More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2222 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
301 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  55.09 
 
 
302 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  52.1 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  51.03 
 
 
299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  52.28 
 
 
298 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
301 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  52.16 
 
 
307 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  51.39 
 
 
297 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
298 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  48.6 
 
 
304 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  47.77 
 
 
309 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  48.46 
 
 
302 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  49.47 
 
 
286 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  44.98 
 
 
296 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  46.67 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  45.89 
 
 
298 aa  231  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  42.61 
 
 
328 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  49.12 
 
 
319 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  44.11 
 
 
300 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  42.61 
 
 
328 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  41.5 
 
 
343 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  47.5 
 
 
300 aa  225  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 
330 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 
300 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  43.59 
 
 
330 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  44.32 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 
329 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 
331 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  44.1 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  42.36 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  45.92 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 
331 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  41.95 
 
 
318 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
302 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.46 
 
 
319 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  45.42 
 
 
292 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 
313 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  42.46 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  43.21 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
345 aa  195  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  35.37 
 
 
345 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  43.42 
 
 
305 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  43.34 
 
 
301 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  44.61 
 
 
291 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  41.08 
 
 
284 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
319 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  44.91 
 
 
355 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  44.06 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  37.58 
 
 
306 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
285 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
304 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  34.98 
 
 
287 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  35.34 
 
 
287 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
356 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  34.98 
 
 
287 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  34.98 
 
 
287 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  35.14 
 
 
287 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
288 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  32.45 
 
 
284 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  31.79 
 
 
284 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
311 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  34.06 
 
 
287 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 
290 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  35.69 
 
 
294 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
285 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
296 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  31.25 
 
 
336 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  31.25 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 
288 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
284 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
280 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
304 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  34.88 
 
 
265 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  31.74 
 
 
265 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
321 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.51 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.97 
 
 
256 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.1 
 
 
251 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  34.04 
 
 
397 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.46 
 
 
261 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.59 
 
 
260 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
260 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>