More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00763 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  100 
 
 		 278 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  53.75 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  53.75 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  48.26 
 
 		 266 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  46.46 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  41.31 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  41.31 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  43.44 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  43.46 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  43.46 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  43.46 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  43.04 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  43.04 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  43.04 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  43.04 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.27 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.73 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.4 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.06 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.3 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.74 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  25.75 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.07 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.35 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.73 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 		 262 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.1 
 
 		 425 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 259 aa  89.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 267 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  25.68 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  26.34 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.3 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  24.49 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  25.91 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>