More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1674 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  54.7 
 
 		 286 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  48.94 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  47.72 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  48.96 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  45.64 
 
 		 314 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  47.5 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  49.65 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  40.64 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  47.47 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  41.94 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  44.41 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  40.61 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  39.04 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  42.75 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  40.7 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  41.4 
 
 		 378 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  40.06 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.31 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 343 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  38.26 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  39.65 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  40 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  38.65 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  33.68 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 		 345 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 		 331 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  40.53 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  37.88 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  32.74 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  32.74 
 
 		 359 aa  148  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  30.24 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  29.9 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 356 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  30.58 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  30.24 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  35.02 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  29.55 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  29.9 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  25.52 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  38.19 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.24 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.86 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.12 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>