More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1246 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  98.5 
 
 
266 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  98.5 
 
 
266 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  98.5 
 
 
266 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  97.74 
 
 
266 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  97.74 
 
 
266 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  97.74 
 
 
266 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  96.98 
 
 
270 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  77.19 
 
 
270 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  48.15 
 
 
267 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  48.95 
 
 
259 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  46.15 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  45.83 
 
 
259 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  46.99 
 
 
266 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  43.44 
 
 
278 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
260 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 
261 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
265 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  26.14 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.64 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  22.83 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.72 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.05 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.64 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.46 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.61 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.33 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.72 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.35 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  24.9 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.13 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.02 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.53 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.4 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  32.87 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  25.19 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  25.9 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  21.67 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.54 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>