More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3171 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 270 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  67.8 
 
 		 267 aa  387  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  31.37 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  32.33 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  30.74 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.06 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  31.64 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.06 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.89 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  31.08 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.94 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.47 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.18 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.71 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.85 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  28.94 
 
 		 306 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 279 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.39 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.82 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 352 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  30.03 
 
 		 328 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.52 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.18 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 343 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 		 396 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  31.41 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  31.18 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  29.69 
 
 		 328 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.73 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.62 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.08 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>