More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4013 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  65.78 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  59.85 
 
 		 264 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  43.13 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.72 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  46.53 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  34.45 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  33.7 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  34.58 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  35.02 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  30.38 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  31.84 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.89 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  27.94 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.98 
 
 		 269 aa  95.5  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  31.13 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  30.99 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 226 aa  92  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.03 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  29.45 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.45 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 286 aa  88.6  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.1 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.32 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 298 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  28.68 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.62 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  28.89 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.44 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  28.73 
 
 		 322 aa  85.5  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.59 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.6 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  30.34 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.05 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.92 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>