More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2623 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  48.33 
 
 
267 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  37.16 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
271 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
266 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.64 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
270 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
262 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 
265 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
262 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
267 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
263 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.48 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.7 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.88 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.44 
 
 
268 aa  89  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  30.98 
 
 
285 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.31 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.44 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  31.03 
 
 
285 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.37 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
304 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.57 
 
 
284 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.03 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.37 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.97 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08028  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02310)  29.65 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.601439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  29.44 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  26.69 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.56 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.26 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.32 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.33 
 
 
425 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.49 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  30.07 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  29.37 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.35 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.84 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  26.54 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.4 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.94 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  27.56 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.83 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  24.52 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  27.87 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>