More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2404 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.4 
 
 		 425 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  35.98 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.19 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.6 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  32.09 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.09 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  30.36 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  34.38 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  34.9 
 
 		 387 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  33.58 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  34.55 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 387 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.64 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32.69 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.19 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.88 
 
 		 462 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  35.47 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  37.16 
 
 		 396 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 329 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.15 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  33.18 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 296 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.65 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 		 453 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  32.44 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.76 
 
 		 456 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  32.36 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.83 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  32.26 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.63 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.3 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  33.19 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  28.31 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>