More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1084 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  84.5 
 
 		 387 aa  663    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 387 aa  778    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  88.11 
 
 		 387 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  86.82 
 
 		 387 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  40.64 
 
 		 255 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 253 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 273 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.73 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 309 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 254 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 268 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 265 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 265 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  29.41 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.42 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.69 
 
 		 254 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 285 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 302 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 284 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.13 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 260 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 268 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 265 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.15 
 
 		 262 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 285 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 271 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 270 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.76 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 279 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.71 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.08 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.47 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.76 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.95 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  24.33 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.23 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.1 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.38 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.3 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  31.67 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>