More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4731 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  94.77 
 
 		 287 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  78.42 
 
 		 287 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  67.02 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 289 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  59.85 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  56.68 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  56.73 
 
 		 278 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.71 
 
 		 285 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  47.83 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.48 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 		 314 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  37.23 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  38.99 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 286 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  39.65 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  32.05 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.26 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.24 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.99 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  29.37 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.84 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  28.32 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.57 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.94 
 
 		 425 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.55 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  28.31 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.02 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8373  proline iminopeptidase  30.54 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.68 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.71 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.94 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  27.67 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>