More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1826 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
285 aa  583  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  50.18 
 
 
298 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
298 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  49.3 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  44.8 
 
 
277 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 
280 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
284 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  43.37 
 
 
284 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 
285 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  41.49 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  44.64 
 
 
281 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  44.89 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.9 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
287 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  43.12 
 
 
278 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  40.5 
 
 
322 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
287 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 
279 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 
289 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 
282 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
287 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  40.78 
 
 
286 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  38.35 
 
 
314 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.74 
 
 
295 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
284 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
275 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
331 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  31.77 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
266 aa  109  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
274 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
284 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.54 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
302 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  29.12 
 
 
318 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.85 
 
 
278 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  35.83 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.52 
 
 
300 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.6 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  30.15 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.6 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
304 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.97 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  30.91 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.22 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.57 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
350 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.73 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  43.81 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>