More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5070 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
271 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
271 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
271 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  39.49 
 
 
284 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 
284 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  41.6 
 
 
298 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
298 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
280 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
285 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 
289 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  35.27 
 
 
277 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
314 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  35.29 
 
 
286 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 
287 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
287 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
278 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  35.2 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  37.05 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
285 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
286 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.2 
 
 
285 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
279 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  34.08 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
331 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 
282 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.69 
 
 
295 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 
316 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
284 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
266 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
274 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  27.73 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.2 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.41 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.36 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  28.19 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  28.19 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.73 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.3 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.95 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.17 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.57 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  26.52 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.81 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.76 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.9 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.39 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.97 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.39 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  26.98 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  26.51 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.52 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  25.97 
 
 
2063 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.54 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  21.86 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.24 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.17 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.24 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.02 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>