More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4596 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
260 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  51.56 
 
 
298 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  45.1 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  46.64 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  40.38 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  43.32 
 
 
285 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  43.37 
 
 
285 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  44.49 
 
 
280 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  40 
 
 
283 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  43.37 
 
 
285 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  41.37 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  39.62 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  41.37 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  42.13 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
261 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  39.25 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1944  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
249 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 
266 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.47 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.34 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  34.14 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  27.61 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.67 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.67 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.67 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  30.34 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.57 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  30.51 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  34.73 
 
 
391 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.52 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  30 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  31.5 
 
 
397 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  28.05 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.71 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.45 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  33.04 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  24.52 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.57 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.11 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  25.46 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.16 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  30.63 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  23.69 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>