More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0111 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  79.14 
 
 
287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  78.42 
 
 
287 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  69.09 
 
 
286 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  71.58 
 
 
289 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  59.77 
 
 
322 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  62.55 
 
 
286 aa  328  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  56.78 
 
 
278 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 
285 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.82 
 
 
285 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  49.82 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.48 
 
 
295 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  38.63 
 
 
314 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
285 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 
284 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
284 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 
278 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  40.36 
 
 
281 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  36.43 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  36.82 
 
 
298 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
279 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
275 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  30.89 
 
 
277 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.85 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
283 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.23 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
325 aa  85.5  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.76 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.12 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  28.57 
 
 
285 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2791  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
316 aa  79  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  28.21 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  28.32 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  27.78 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.54 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.12 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  27.17 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.18 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.19 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  24.44 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  29.3 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.44 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  26.61 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.03 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.78 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.07 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.07 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>