More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5168 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
281 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  83.15 
 
 
280 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  53.57 
 
 
288 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
284 aa  301  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  45.23 
 
 
356 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  45.23 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  43.17 
 
 
359 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  43.17 
 
 
336 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  44.52 
 
 
287 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  44.52 
 
 
287 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  44.88 
 
 
287 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  44.88 
 
 
287 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  44.88 
 
 
287 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  44.17 
 
 
287 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  43.93 
 
 
284 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  45.32 
 
 
279 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  42.76 
 
 
284 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  44.88 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 
290 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  39.03 
 
 
291 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
296 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  38.29 
 
 
281 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
288 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 
304 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 
309 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
321 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
304 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  34.74 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
302 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
304 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
302 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
286 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
302 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
300 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
297 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  31.42 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 
319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
300 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  30.87 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
298 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
330 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
297 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
356 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  32.56 
 
 
307 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
331 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  31.67 
 
 
328 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
343 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
331 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  30.96 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  31.64 
 
 
378 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
345 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
312 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  32.06 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
319 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  32.16 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
302 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
284 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
355 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
334 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 
300 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
274 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
284 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
299 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  29.27 
 
 
318 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.89 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.52 
 
 
256 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.52 
 
 
256 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
285 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
272 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
267 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>