More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0307 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 322 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  76.17 
 
 		 278 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  64.96 
 
 		 285 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  57.04 
 
 		 286 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  59.77 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  52.98 
 
 		 285 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  56.68 
 
 		 287 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  52.86 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  55.96 
 
 		 287 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  49.46 
 
 		 286 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  51.46 
 
 		 289 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.55 
 
 		 295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  43.22 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 286 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  41.97 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  42.86 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  41.22 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 		 280 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  39.16 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  30.04 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.6 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 267 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.62 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 277 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  23.96 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.12 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.85 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  26.32 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.3 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  27.37 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.33 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.76 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.92 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.26 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.57 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.78 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.19 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  26.95 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  25.63 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  33.18 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>