More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2383 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  100 
 
 		 294 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  46.69 
 
 		 285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  47.94 
 
 		 283 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  47.37 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  47.37 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  45.11 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  47.57 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  46.99 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  46.62 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  46.24 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  46.44 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  48.33 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  47.17 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  40.08 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  37.55 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  30.08 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 266 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  29.6 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 285 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.8 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  29.03 
 
 		 378 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  28.72 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 264 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  33.58 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 267 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  30.42 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  34.66 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  30.67 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  31.33 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 		 262 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 270 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 265 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 280 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.91 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  30.67 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  29.76 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.53 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  29.09 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  29.81 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  29.83 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  28.94 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  29.63 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  30.25 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>