More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4538 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
284 aa  584  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  57.86 
 
 
298 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  55.96 
 
 
298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 
278 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  50.36 
 
 
277 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  44.25 
 
 
286 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  44 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  42.09 
 
 
285 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  41.49 
 
 
278 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  41.79 
 
 
286 aa  222  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  40.49 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  42.44 
 
 
322 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  42.6 
 
 
282 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 
279 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 
285 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
287 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
287 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.37 
 
 
285 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 
271 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 
271 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 
271 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  34.41 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.23 
 
 
295 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
331 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
266 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  31.92 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
316 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.57 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.96 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
308 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.04 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.47 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.72 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  25.45 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  25.66 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.24 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
352 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  26.14 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.57 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
312 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  24.82 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  26.67 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>