More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5218 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
314 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  43.22 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  41.67 
 
 
277 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  41.1 
 
 
298 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  38.63 
 
 
286 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 
280 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
285 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
298 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
284 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 
278 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  38.63 
 
 
287 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 
287 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 
287 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  36.1 
 
 
284 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
286 aa  192  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  38.35 
 
 
285 aa  185  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  35.59 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  35.64 
 
 
286 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 
279 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
285 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.85 
 
 
285 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
289 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.53 
 
 
295 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
266 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  30.11 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
275 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.2 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 
265 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.92 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.92 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.25 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.43 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.43 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.09 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  26.1 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.92 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  24.92 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.58 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.58 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  31.09 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.87 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.99 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.23 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  23.89 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  27.13 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  22.52 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.11 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  23.81 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  22.11 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>