More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6652 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  88.77 
 
 		 277 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  61.23 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  61.59 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  51.43 
 
 		 284 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 		 285 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  44.16 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  46.57 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  41.73 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 		 284 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  42.75 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  39.16 
 
 		 286 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  40.36 
 
 		 322 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  39.71 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.14 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  39.59 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  34.53 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.55 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  31.09 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.47 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  23.74 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  28.21 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  25.48 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  25.48 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.73 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.11 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.84 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  22.14 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  24.82 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  24.47 
 
 		 330 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  23.95 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  22.59 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  22.66 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.47 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  22.33 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  24.54 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  25.36 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.9 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  22.26 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.32 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  23.44 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  27.02 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  23.31 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  25.26 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.82 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>