More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0585 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  80.99 
 
 
283 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
266 aa  152  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.02 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  29.31 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.64 
 
 
279 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
226 aa  92.4  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.63 
 
 
286 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  28.57 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  37.5 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  27.9 
 
 
233 aa  86.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  27.47 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.34 
 
 
296 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  39.25 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  33.05 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  26.99 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  39.25 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  35.23 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.76 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.89 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.89 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
254 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.46 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.57 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.09 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  38.6 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.29 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  28.19 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  31.9 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.74 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  34.27 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  24.23 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  29.86 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
356 aa  75.5  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  36.89 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.42 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.21 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  37.19 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  31.25 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  23.4 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>