More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
295 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  45.62 
 
 
285 aa  266  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  45.55 
 
 
322 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  43.22 
 
 
286 aa  248  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.56 
 
 
285 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  45.2 
 
 
287 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
287 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  44.29 
 
 
286 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 
289 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
285 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  36.53 
 
 
314 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
284 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
284 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  37.87 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
298 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  33.82 
 
 
277 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
285 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  32.59 
 
 
281 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
266 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.06 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.11 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.11 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.43 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.74 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.57 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.37 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.2 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.2 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  29.33 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  26.91 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  26.48 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.93 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  39.42 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.63 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
387 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 
392 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.09 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
261 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>