More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3444 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
311 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  44.25 
 
 
307 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  45.33 
 
 
292 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  40.06 
 
 
300 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  40.28 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 
313 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
297 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
304 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 
296 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 
302 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 
300 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
281 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
300 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 
305 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
280 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  37.02 
 
 
298 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 
301 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  34.1 
 
 
306 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  37.59 
 
 
318 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
288 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
298 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  33.69 
 
 
291 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 
297 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  36.58 
 
 
306 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
285 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 
356 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  33.07 
 
 
287 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
284 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  36.58 
 
 
307 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  34.42 
 
 
304 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  32.2 
 
 
287 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  32.2 
 
 
287 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  34.56 
 
 
328 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
329 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
299 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  30.66 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  31.82 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  32.2 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  30.66 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  34.34 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  33.07 
 
 
287 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  31.42 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  36.73 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 
331 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  31.94 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 
308 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  34.28 
 
 
378 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
331 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  32.06 
 
 
330 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
302 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
330 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
300 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
319 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
343 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 
319 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
334 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
274 aa  92.4  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
275 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
284 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.1 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  31.01 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.36 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>