More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2890 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 308 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  57.14 
 
 		 305 aa  301  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  47.47 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  49.49 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  46.72 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  44.9 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  38.6 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  43.08 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  38.08 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  38.35 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  38.28 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  39.59 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  33.45 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  33.45 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  39.43 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  33.72 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  28.17 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 285 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  29.51 
 
 		 284 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  29.18 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 281 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  29.18 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  28.83 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  28.47 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  28.67 
 
 		 356 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.23 
 
 		 262 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  26.98 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  26.98 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.37 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.77 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  33.59 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>