More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
285 aa  579  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  56.38 
 
 
285 aa  331  9e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  52.98 
 
 
322 aa  325  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  54.95 
 
 
278 aa  318  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  53.82 
 
 
287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  51.79 
 
 
287 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 
287 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  49.64 
 
 
282 aa  285  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  50.18 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  45.39 
 
 
286 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  48.54 
 
 
289 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.56 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  40.29 
 
 
298 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
298 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 
280 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
286 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 
285 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  36.96 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  40.35 
 
 
281 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
266 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
275 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.85 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.71 
 
 
268 aa  89  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
265 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.28 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.28 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  34.43 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.18 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.94 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.89 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.32 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.51 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
267 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.16 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  23.24 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  23.24 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  28.62 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.24 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.24 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.81 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  26.97 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  26.97 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.02 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>