More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1087 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 342 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  72.5 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  71.69 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  81.82 
 
 		 278 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  81.45 
 
 		 278 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  80.8 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  82.18 
 
 		 278 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  81.45 
 
 		 278 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  80.22 
 
 		 280 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  79.06 
 
 		 278 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  80.58 
 
 		 280 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  78.34 
 
 		 278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  77.74 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6475  alpha/beta hydrolase fold  80.07 
 
 		 278 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5723  alpha/beta hydrolase fold  79.71 
 
 		 278 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 		 278 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 		 278 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 		 278 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3910  alpha/beta hydrolase fold  78.83 
 
 		 278 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0228163  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3628  alpha/beta hydrolase fold  77.74 
 
 		 278 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  74.28 
 
 		 278 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2211  alpha/beta hydrolase fold  74.28 
 
 		 278 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  73.12 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  68.29 
 
 		 343 aa  424  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  72.36 
 
 		 276 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  72.83 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  74.91 
 
 		 278 aa  421  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  72.46 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  72.46 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  71.12 
 
 		 276 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  71.27 
 
 		 276 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  70.76 
 
 		 276 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  69.31 
 
 		 276 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  69.57 
 
 		 276 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  69.45 
 
 		 276 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  70.04 
 
 		 276 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  69.09 
 
 		 276 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  71.48 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  68.36 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  66.67 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  69.45 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 		 274 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  68.73 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  68.73 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  68.73 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  66.55 
 
 		 277 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  68 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  66.91 
 
 		 274 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  64.62 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  64.96 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  67.15 
 
 		 274 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  62.91 
 
 		 274 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  63.9 
 
 		 273 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  63.04 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  63.18 
 
 		 274 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  60.65 
 
 		 273 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  60.51 
 
 		 271 aa  355  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  61.45 
 
 		 280 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  61.45 
 
 		 273 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 		 273 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  58.48 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  60.29 
 
 		 273 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  60.29 
 
 		 273 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  54.34 
 
 		 317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 		 274 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  59.21 
 
 		 273 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  59.21 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  57.45 
 
 		 273 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  57.4 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  57.4 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  57.4 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  57.91 
 
 		 274 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  56.36 
 
 		 273 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  57.09 
 
 		 273 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  56.18 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  58.12 
 
 		 273 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  55.07 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  52.32 
 
 		 322 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  54.35 
 
 		 340 aa  322  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  55.48 
 
 		 324 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  50 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  55.04 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  56.16 
 
 		 277 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  55.76 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  57.09 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  57.09 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  57.09 
 
 		 273 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  54.51 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  50.31 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  54.48 
 
 		 273 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  50.47 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  55.64 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  55.64 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  54.42 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  55.43 
 
 		 273 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  55.27 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  54.98 
 
 		 273 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  54.18 
 
 		 274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  54.18 
 
 		 273 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>