More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1265 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
267 aa  556  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  67.8 
 
 
270 aa  387  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
267 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 
271 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
284 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 
268 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  33.06 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
260 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 
265 aa  118  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
281 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
281 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
281 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 
270 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.85 
 
 
269 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
298 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
265 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
264 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
264 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
279 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 
250 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.27 
 
 
265 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.69 
 
 
264 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
286 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.91 
 
 
425 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
270 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
264 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 
270 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
274 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
266 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.97 
 
 
308 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
268 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
267 aa  99  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
269 aa  99  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
264 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
296 aa  99  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.86 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  28.88 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.88 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.88 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
284 aa  95.5  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.88 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.88 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.88 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.63 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
283 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
263 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
266 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 
253 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.67 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.37 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.98 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
267 aa  92.4  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.28 
 
 
286 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.98 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.58 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  28.01 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08028  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02310)  39.69 
 
 
334 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.601439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.49 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.11 
 
 
397 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>