More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4759 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 331 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  33.2 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 		 266 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  34.47 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  30.68 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  31.06 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  30.51 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  29.37 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 284 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  33.73 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 267 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 271 aa  96.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 274 aa  92.8  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  28.57 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.72 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.28 
 
 		 264 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  28.96 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  27.8 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  28.96 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  28.96 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 284 aa  86.7  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.62 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  28.1 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  30.16 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.59 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.86 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  27.92 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.44 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.34 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  28.29 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  28.29 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  29.17 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  28.94 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  29.45 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>