More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2477 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  71.58 
 
 		 287 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  69.4 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  60.78 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  54.55 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  51.46 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  48.55 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  51.65 
 
 		 278 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  48.54 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  48.38 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.23 
 
 		 295 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  39.56 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 		 284 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  41.55 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  39.18 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  39.79 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  39.79 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  31.77 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  34.72 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 331 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 316 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.56 
 
 		 425 aa  95.5  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.73 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.45 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  30.98 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.86 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.11 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.06 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.04 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.25 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  28.97 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.17 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.17 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.15 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  28.74 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.25 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  36.29 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.17 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.92 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.4 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.78 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>